斯奈德原本计划让约翰·斯图尔特在《正义联盟》中登场,也确实拍摄了一场绿灯侠的场景,但是制片公司对角色和场景有不同的看法,这个场景最终没有出现在斯奈德版中。作为吉卜力工作室的开山之作,《天空之城》所传递的“只要努力梦想就会成真”的主题,贯穿了电影内外。与电影中的巴鲁父子一样,“飞行”一直是宫崎骏执着喜爱的重要元素,于是他将关于飞翔的诸多想象和梦想置于这部电影中。比如电影中海盗们所使用的小型扑翼机“Flaptor”,宫崎骏就花了很多时间来思考,如何以手绘动画的形式,还原出如蜻蜓羽翼般轻巧的动态残影效果。